PROGRAM STUDI AGRIBISNIS merupakan program studi yang berkonsentrasi pada peningkatan skill dan keilmuan di bidang sosial ekonomi pelaku usaha pertanian. Mencetak para sarjana unggul berstandar internasional dan mampu berperan aktif dalam pengembangan agribisnis melalui sistem pertanian berlanjut menjadi fokus utama program studi yang berlatar pada basis sosial ekonomi pertanian.

PROGRAM STUDI ILMU TANAH menciptakan para lulusannya dengan keahlian spesifik dalam pengelolaan tanah dan sumber daya lahan secara berkelanjutan. Para lulusan dapat kerja dengan Jenis dan jenjang karier yang bervariasi seperti di Kementerian Pertanian, Kementerian Lingkungan Hidup dan Kehutanan, BIG, atau BUMN dan institusi swasta di bidang pertanian, perkebunan dan kehutanan.  Secara umum, karier di sektor pertanian dan perkebunan umumnya jadi pilihan utama bagi Sarjana Pertanian bidang Ilmu Tanah.

PROGRAM STUDI KEHUTANAN merupakan program studi perintis dan pembaharu (standard setting) bertaraf internasional dalam pengelolaan sumber daya hutan lestari berbasis sistem sosial ekologi, ilmu pengetahuan dan teknologi. Para Rimbawan akan ikut menguasai dan menyebarluaskan inovasi sosial, IPTEK dalam upaya pemecahan masalah di sektor (Agro)-kehutanan dalam skala nasional dan global.

PROGRAM STUDI PROTEKSI TANAMAN atau yang juga dikenal sebagai Program Studi Ilmu Hama dan Penyakit Tumbuhan merupakan jurusan yang mempelajari tentang pengamanan produksi pertanian melalui manajemen kesehatan tanaman. Jurusan ini lebih fokus pada isu-isu pengelolaan hama dan penyakit berkelanjutan dan bertujuan untuk konservasi lingkungan dan juga manajemen sumber daya hayati dalam rangka memelihara keseimbangan agroekosistem. Program studi ini juga dikenal dengan istilah Program Dokter Tanaman.

PROGRAM STUDI AGROEKOTEKNOLOGI  Fakultas Pertanian Universitas Bengkulu adalah PS gabungan dari tiga Program Studi yang ada sebelumnya, yakni PS Agronomi, PS Ilmu Tanah dan PS Ilmu Hama dan Penyakit Tumbuhan. Program Studi Agroekoteknologi berdiri pada tanggal 18 Maret 2010 melalui Surat Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Kementerian Pendidikan Nasional, Republik Indonesia Nomor 294/D/T/2010. 

PROGRAM STUDI ILMU KELAUTAN memberikan penguasaan dan keterampilan mahasiswa di bidang Biologi Laut, Ekologi Laut, Oseanografi, Pemetaan, Penginderaan Jauh, Sistem Informasi Geografi, Akustik Kelautan, Penyelaman Ilmiah, Konservasi, Teknik Rehabilitasi, serta Bioteknologi, sehingga lulusannya akan mampu mengidentifikasi dan memformulasikan penyelesaian masalah eksplorasi dan konservasi sumberdaya dan lingkungan laut secara sistematis. 

PROGRAM STUDI TEKNOLOGI INDUSTRI PERTANIAN adalah program studi yang fokus kepada pengembangan teknologi di bidang pertanian serta implementasinya dalam menunjang kemajuan industri pertanian. Para lulusan dari Teknologi Industri Pertanian akan mampu menguasai kaidah penelitian yang bersifat filosofis maupun aplikatif sehingga nantinya diharapkan dapat menghasilkan berbagai solusi yang tepat yang berhubungan dengan dunia industri modern.

PROGRAM STUDI PETERNAKAN, Jurusan Peternakan fokus mempelajari teknologi pemeliharaan, pengelolaan, pengembangan, hingga pemasaran hewan ternak beserta hasil ternaknya agar memiliki nilai tambah. Para mahasiswa di program studi ini tidak hanya belajar memelihara dan mengelola hewan ternak agar tetap dalam kondisi sehat dan prima, tetapi juga mengembangkan teknologi ternak, pakan ternak dan memasarkan hasil produksi dan olahannya.

PROGRAM MAGISTER AGROEKOTEKNOLOGI ini diarahkan untuk menghasilkan lulusan dengan memiliki kemampuan untuk mengembangkan dan memutakhirkan ilmu pengetahuan di agroekoteknologi dengan cara menguasai dan memahami metode, kaidah ilmu, dan keterampilan penerapannya. Para lulusannya juga diharapkan mempunyai kemampuan untuk memecahkan permasalahan di bidang agroekoteknologi melalui kegiatan penelitian dan pengembangan berdasarkan kaidah ilmiah serta mempunyai kemampuan untuk mengembangkan kinerja profesional yang ditunjukkan dengan ketajaman analisis permasalahan, keserbacakupan tinjauan, dan kepaduan integritas pemecahan masalah.